Met het Leids Universiteits Fonds is de stichting een samenwerkingsovereenkomst aangegaan, waarin is opgenomen dat de stichting jaarlijks een bedrag van in beginsel € 75.000 toezegt ter subsidiëring van projecten van wetenschappers verbonden aan de Universiteit Leiden, waarbij het LUF de schenking van de stichting zal matchen. In 2023 ontving het LUF een bedrag van € 74.406.
Leids Universiteits Fonds
Stichting Armoedefonds
De schoolspullenactie is een project van Stichting Armoedefonds, waarmee kinderen geholpen worden die in armoede opgroeien en starten op de middelbare school. Zij ontvangen een Schoolspullenpas, waarmee ze zelf voor € 50 school- en gymspullen kunnen uitkiezen. Zo worden ze geholpen om een goede start te maken op de middelbare school en ook spullen uit te kunnen zoeken die ze zelf mooi vinden en bij hen passen. De stichting stelde € 5.000 ter beschikking.
Nationale Denktank
Met de Nationale Denktank is een overeenkomst aangegaan voor de jaren 2021 – 2023, waarin is vastgelegd dat Stichting Elise Mathilde Fonds per jaar een bedrag van € 20.000 doneert ten behoeve van de activiteiten van de stichting, waaronder de organisatie van de jaarlijkse Nationale DenkTank. In 2023 is de laatste uitkering gedaan.
IMC Weekendschool
IMC Weekendschool (Kunst & Cultuur onderwijs in Rotterdam en Utrecht) heeft € 45.000 toegekend gekregen voor de jaren 2023-2025, uit te betalen in drie termijnen (€ 15.000 per jaar). Het doel van IMC Weekendschool is dat jongeren van alle schoolniveaus en alle sociale achtergronden een plek in de samenleving kunnen innemen die past bij hun interesses en capaciteiten.